Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnar1P33896 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms