Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd44P15379 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd44P15379 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd44P15379 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd44P15379 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms