Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tom1O88746 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tom1O88746 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tom1O88746 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tom1O88746 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tom1O88746 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tom1O88746 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tom1O88746 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tom1O88746 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tom1O88746 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms