Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i1O88485 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms