Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52l1O54818 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms