Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrcpO35427 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrcpO35427 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrcpO35427 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CrcpO35427 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CrcpO35427 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrcpO35427 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrcpO35427 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrcpO35427 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CrcpO35427 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CrcpO35427 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrcpO35427 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms