Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc1O35379 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Abcc1O35379 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc1O35379 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc1O35379 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc1O35379 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc1O35379 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc1O35379 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc1O35379 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc1O35379 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc1O35379 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc1O35379 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc1O35379 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abcc1O35379 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abcc1O35379 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Abcc1O35379 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Abcc1O35379 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abcc1O35379 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc1O35379 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc1O35379 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc1O35379 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc1O35379 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc1O35379 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc1O35379 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc1O35379 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc1O35379 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc1O35379 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms