Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ArxO35085 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ArxO35085 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ArxO35085 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ArxO35085 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ArxO35085 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ArxO35085 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ArxO35085 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ArxO35085 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ArxO35085 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ArxO35085 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ArxO35085 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ArxO35085 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ArxO35085 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ArxO35085 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArxO35085 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArxO35085 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArxO35085 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArxO35085 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ArxO35085 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ArxO35085 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ArxO35085 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ArxO35085 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArxO35085 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArxO35085 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArxO35085 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ArxO35085 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArxO35085 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArxO35085 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArxO35085 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArxO35085 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArxO35085 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArxO35085 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArxO35085 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArxO35085 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArxO35085 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArxO35085 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArxO35085 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArxO35085 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ArxO35085 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArxO35085 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArxO35085 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArxO35085 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArxO35085 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArxO35085 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArxO35085 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ArxO35085 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ArxO35085 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ArxO35085 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArxO35085 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ArxO35085 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ArxO35085 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ArxO35085 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ArxO35085 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ArxO35085 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ArxO35085 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArxO35085 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArxO35085 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArxO35085 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArxO35085 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArxO35085 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArxO35085 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArxO35085 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArxO35085 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArxO35085 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArxO35085 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArxO35085 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArxO35085 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ArxO35085 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ArxO35085 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ArxO35085 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ArxO35085 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ArxO35085 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArxO35085 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ArxO35085 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ArxO35085 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ArxO35085 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ArxO35085 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ArxO35085 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ArxO35085 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ArxO35085 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms