Protein–RNA interactions for Protein: L7N253

4930555G01Rik, RIKEN cDNA 4930555G01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930555G01RikL7N253 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930555G01RikL7N253 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930555G01RikL7N253 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930555G01RikL7N253 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930555G01RikL7N253 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930555G01RikL7N253 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms