Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms