Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930579F01RikE9Q3L6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930579F01RikE9Q3L6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms