Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnldc1B2RXZ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms