Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Odf2A3KGV1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms