Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RNP2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RNP2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms