Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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