Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28360A0A087WR25 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28360A0A087WR25 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms