Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms