Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Krt6bQ9Z331 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt6bQ9Z331 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms