Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms