Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Pdpk1Q9Z2A0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pdpk1Q9Z2A0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pdpk1Q9Z2A0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pdpk1Q9Z2A0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pdpk1Q9Z2A0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pdpk1Q9Z2A0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pdpk1Q9Z2A0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pdpk1Q9Z2A0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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