Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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