Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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