Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nr2e3Q9QXZ7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nr2e3Q9QXZ7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nr2e3Q9QXZ7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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