Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms