Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 687.2 ms