Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sall1Q9ER74 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms