Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms