Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xab2Q9DCD2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms