Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PacrgQ9DAK2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms