Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms