Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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