Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms