Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptp4a3Q9D658 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms