Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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