Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tmed5Q9CXE7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tmed5Q9CXE7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tmed5Q9CXE7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tmed5Q9CXE7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tmed5Q9CXE7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed5Q9CXE7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tmed5Q9CXE7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms