Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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