Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms