Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms