Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf2ird2Q99NI3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf2ird2Q99NI3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf2ird2Q99NI3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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