Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms