Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PccbQ99MN9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PccbQ99MN9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms