Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RtcbQ99LF4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms