Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms