Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms