Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms