Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms