Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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