Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms