Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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