Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt79Q8VED5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms